De Piloot in Rotterdam, onderdeel van Stichting BOOR, heeft een uitgebreid en doordacht onderwijsprogramma dat zich toespitst op zowel leergebied overstijgende vakgebieden als specifieke leergebieden. De school hanteert kerndoelen, verdeeld over zes thema's, waaronder werkhouding, werken volgens plan, gebruik van leerstrategieën, zelfbeeld, sociaal gedrag en nieuwe media, die de basis vormen voor het onderwijsaanbod.

Binnen de zes leergebieden, zoals Nederlandse taal, Engelse taal, rekenen/wiskunde, oriëntatie op mens en wereld, lichamelijke opvoeding, en kunstzinnige oriëntatie, streeft De Piloot ernaar om elke leerling naar een passend eindniveau te begeleiden bij het verlaten van de school.

Het didactisch aanbod is afgestemd op de verschillende leeftijdsgroepen. In de onderbouw ligt de nadruk op het versterken van zelfvertrouwen, zelfredzaamheid, taakgericht gedrag en sociale vaardigheden. In de bovenbouw ontvangen de leerlingen specifiek onderwijs, met extra aandacht voor leerlingen met faalangst, aandachts- en gedragsproblemen, waarbij de methode Wijzer Onderwijs als leidraad dient.

Een aanzienlijk deel van de lessen maakt gebruik van Snappet, een adaptief onderwijsplatform dat momenteel gericht is op het vak rekenen. De voordelen van digitaal onderwijs, zoals verbeterde leerresultaten, beter klasinzicht, gepersonaliseerde leerdoelen, eenvoudige differentiatie en directe feedback, worden volledig benut.

De school hecht grote waarde aan sociaal-emotionele ontwikkeling, ondersteund door de Gouden Regels en het "Zien!" volgsysteem, dat een helder beeld geeft van de sociaal-emotionele ontwikkeling van elke leerling.

Voor kinderen met lees- en spellingsproblemen biedt De Piloot ondersteuning via de Leeskliniek en het Dyslexieprotocol. Het ondersteuningsprofiel omvat de Herstart-afdeling, waar leerlingen van 5-13 jaar worden geplaatst voor observatie, diagnostiek en het formuleren van een aangepast onderwijsplan.

In lijn met het doorstroombeleid evalueert de school de ontwikkeling en het eindniveau van elk kind, rekening houdend met het beginniveau, de mogelijkheden, het onderwijsaanbod en de afstemming met ouders. Als onderdeel van Stichting BOOR neemt De Piloot deel aan het landelijke doorstroomtoetsprogramma en ondersteunt het ouders en leerlingen bij de aanmelding voor het Voortgezet (Speciaal) Onderwijs.